Анна Анатольевна окончила ОмГМА, обучалась в аспирантуре при кафедре нормальной физиологии Кубанского государственного медицинского института с 1981 г. по 1984 г.
С 1996 г. по 2001 г. обучалась в клинической ординатуре, а затем в аспирантуре на кафедре пропедевтики детских болезней и поликлинической педиатрии. В 2001 г. защитила кандидатскую диссертацию на тему «Врожденные пороки сердца у детей: эпидемиология, принципы профилактики».