Сегодня в структуре областной детской клинической больницы:
- многопрофильный круглосуточный стационар на 383 койки, имеющий в своем составе 13 клинических отделений специализированного профиля, а также дневной стационар на 25 коек, функционирующий в составе поликлиники;
- консультативная поликлиника, где оказывается медицинская помощь детям по 28 врачебным и 2 педагогическим специальностям;
- медико-генетическая консультация для пренатальной диагностики врожденных заболеваний плода у беременных женщин, обследования новорожденных с целью раннего выявления наследственных заболеваний.
В декабре 2005 года в больнице было создано отделение реанимации новорожденных, оснащенное современной дыхательной аппаратурой, средствами контроля жизненно важных функций пациентов, инкубаторами для выхаживания маловесных детей, современным лабораторным оборудованием.